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Dimanche 29 avril 2007

Faisant suite à notre article du 20 avril 2007 (lien ici), voici quelques précisions sur ces trois évolutions du virus H5N1 qui se sont propagées en Europe, au Moyen-orient et en Afrique ( E M A ).

Avec cette carte provenant de l'université du maryland, nous avons une vue plus complète de ce phénomène.

 

Les flèches représentent le mouvement du virus H5N1 dans les trois régions distinctes représentées dans cette étude portant sur le génome. Les flèches vertes, jaunes et roses correspondent aux 3 formes (dites sous linéages ou clade) de grippe aviaire qui ont émergé ces derniers mois vers l' OUEST. Les flèches oranges montrent quant à elles la source probable de ce virus avec son premier déplacement vers la russie en aout 2005.

Cette étude indique également que les voies migratroires des oiseaux sauvages ne correspondent pas au mouvement des génomes étudiés. Les hommes ont des voies commerciales de poulets entre plusieurs pays présent dans l'étude. 

De plus, il est fréquent que ces transports soient effectués sur de grandes distances. Ces déplacements ajoutés aux normes assez basses de biosécurités  dans la plupart des secteurs ruraux peuvent être une explication comme source d'introduction du virus H5N1 dans quelques pays. 

source complète en anglais: NEWSWISE 

Note: C'est une confirmation montrant que ce virus est aidé dans sa propagation par les activités humaines et qu'il montre toujours autant de facilité à se développer.  

Vendredi 20 avril 2007
Des études génétiques détaillées d'échantillons de grippe aviaire H5N1 prélevés en Europe, au Moyen-Orient et en Afrique, ont révélé l'existence d'une souche euro-africaine distincte de la maladie dans la région et ont placé l'expansion de la maladie sous un nouveau jour.



Les chercheurs ont séquencé l'intégralité des génomes des 36 échantillons de H5N1 prélevés sur des oiseaux trouvés dans la région EMA (Europe, Moyen-Orient et Afrique) et au Vietnam.

La grippe aviaire a été pour la première fois détectée dans la région EMA fin 2005 et début 2006.

Les échantillons provenant de la région EMA étaient étroitement liés, bien qu'ils aient été prélevés sur des oiseaux trouvés dans des régions aussi lointaines que la Slovénie, l'Afghanistan et le Soudan. Les échantillons sont dans un lignage euro-africain distinct des trois autres lignages majeurs d'H5N1 circulant à l'heure actuelle en Asie. Cette souche EMA s'est par la suite divisée en trois sous-lignages.

«C'est la première fois que l'on examine tous les génomes de l'H5N1 en Occident», a commenté Steven Salzberg de l'Université de Maryland, auteur principal du rapport. «Jusqu'à présent, les études ont principalement été effectuées sur des exemples d'Extrême-Orient. Nos études montrent que le virus s'étend vers l'Ouest, et que trois introductions distinctes de l'H5N1 ont eu lieu en Europe, au Moyen-Orient et en Afrique.»

«Le lignage partagé des virus suggère une source génétique unique pour l'introduction de l'influenza (H5N1) en Europe de l'Ouest et en Afrique du Nord et de l'Ouest», écrivent les chercheurs, qui localisent l'origine de cette source soit en Russie, soit dans la province de Qinghai en Chine.



Par ailleurs, alors que les trois sous-lignages évoluent désormais de façon indépendante, un échantillon du virus prélevé sur un poulet nigérian s'est avéré posséder un génome résultant d'une combinaison de deux des sous-lignages de la souche EMA.

Selon les chercheurs, l'apparition des trois sous-lignages dans la même zone géographique signifie qu'il y a de grandes chances pour de telles manifestations de «réassortiment» du virus.

«Une surveillance supplémentaire sera nécessaire afin de déterminer si la souche réassortie s'étend dans la population aviaire et d'évaluer sa capacité à infecter les mammifères», ont noté les chercheurs.


«L'expansion de la souche EMA a coïncidé avec l'apparition rapide de cas sur des mammifères, ainsi que sur des humains en Turquie, en Égypte, en Irak et au Djibouti, et sur des chats en Allemagne, en Autriche et en Irak», préviennent les chercheurs, qui ajoutent que les souches EMA du virus semblent être aussi virulentes que les souches asiatiques, dont presque la moitié des cas humains se sont avérés fatals.

Selon les chercheurs, la vaste dispersion de la maladie suggère également que le mouvement humain, et non la migration des oiseaux sauvages, est principalement responsable de l'expansion rapide de l'H5N1.

«Les humains transportent des poulets à travers de nombreux pays faisant partie de notre étude, souvent sur de longues distances. Associé à des normes de biosécurité faibles dans la plupart des zones rurales, le déplacement de la volaille vivante par les humains est à l'origine de l'introduction de l'H5N1 dans certains pays.»

Source: Forum influenza H5N1 (Merci Gene). Pour suivre les derniers posts sur ce thème, en particulier l'étude des souches citées, cliquez sur ce lien.
Mercredi 2 août 2006

Voici un site où vous pouvez obtenir l'ensemble des souches grippales actuellement connues. Son utilisation est simple.

Site

par exemple voici toutes les souches H5N1 entrées dans cette base.

Dimanche 15 janvier 2006

Une résistance  à l' Adamantane est observée dans les virus courants de la grippe H3N2 (grippe traditionnelle)

 Avec la saison de grippe atteignant son apogée,  2 médicaments étaient typiquement prescrits pour combattre ce type de grippe et sont jugés inefficaces cette saison.

 Le CDC a trouvé dans les tests que l'adamantadine et la rimantadine, deux  antiviraux , étaient à  91 pour cent inefficaces contre la grippe H3N2, contrainte dominante cette saison.

Cependant, 2 autres drogues, le Tamiflu et Relenza (et oui encore eux) sont encore efficaces.

L'amantadine et la rimantadine sont des médicaments plus anciens, moins-chers et moins prescrits. Il y a eu une tendance globale vers la résistance aux antiviraux. Le CDC ajoute : "nous ne connaissons pas exactement pourquoi la résistance a monté à ces antiviraux" 

Note ryback: J'ai des connaissances qui ont eu la grippe cette année, et cet article peut expliquer la durée de la grippe une fois malade.

Dimanche 8 janvier 2006

Fichier mis à jour le 08/01/06: Souches H5N1 année 2005.

Bonjour, les sous types et les différentes souches prenant de plus en plus de place, l'ensemble des données sont indexées à partir d'aujourd'hui sur un fichier tableur de works ce qui permet une facilité dans la mise à jour, la recherche.

Vous pouvez récupérer directement ce fichier en cliquant ici.

 Lors du téléchargement, une erreur vous est transmise, c'est pareil chez moi, cela provient du fait que ce fichier est déposé sur over-blog. Cliquez sur enregistrer car ouvrir on ne peut pas......... Dommage.

 

 

 
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